１。政府鼓励支持热电联产，但相关部门尚不协调
在国家计委、国家经贸委等部门相关文件中，均提出鼓励支持发展热电联产，但金融、税收等部门并未出台相应措施，缺少实质性支持。
２。能源部门却少有权威性的统管机关
在国家机构调整后，目前石油、煤炭天然气、电力均为各自独立的公司，公司讲经营、讲效益。全国能源的统筹安排、合理利用缺少权威性的机关统盘考虑，因而国家支持热电发展的政策尚不具体。
３。热电联产尚未从环保中受益
目前已有越来越多的单位认识到热电联产是节约能源改善环境的有效措施，但直至目前热电联产的发展尚未从环保领域收益，个别地方的环保部门还将热电厂作为一个重要污染源来对待。
４。现行的《中华人民共和国电力法》中无热电联产的内容
热电联产本来是电力工业中的一个重要内容，但很遗憾，“电力法”，中未提及热电联产，我们期待新修订的“电力法”会有所反映。
５。热电联产企业尚未进入真正的市场经济
目前，我国正由计划经济向市场经济过渡，现在热电厂生产需要的燃料、水、化学药品和其他物品均已进入市场，而热电厂的产品电和热，尽管目前大家一认识到是产品，但其出厂价格则由政府定价，所以每当燃料价格上涨而电价不动时，热电厂的领导则叫苦连天。
６。燃料结构调整带来的新课题
陕甘宁天然气进京，“西气东输”工程的建设，为许多地区改变燃料结构创造了有利条件，也为发展燃气—蒸汽联合循环热、电、冷联产提供了极好的机遇。但目前天然气价格偏高，相对于燃煤工程增加成本，而在竞价上网方面尚未出台新的政策，因而制约了先进技术的发展。